Geometria de equilíbrio da molécula de Azadiracthin através de métodos semiempíricos e Ab initio em comparação com os dados experimentais fornecidos pela difração de raios X

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Daniel Augusto Barra de Oliveira
Yagly Grasielle dos Santos Gomes

Abstract

A azadiractina é uma molécula com múltiplas aplicações biológicas no combate de pragas e no tratamento de doenças em humanos. Por essa razão,o estudo da geometria deste tipo de estrutura molecularé essencial para o entendimento dos processos bioquímicos nos quais ela está envolvida. O estudo de geometrias de equilíbrio é realizado com o auxílio de aproximações quânticasque conseguem determinar estruturas de menor estado energético.A importância desse tipo de trabalho é verificada quando há reprodutibilidade dos dados experimentais pelos cálculos quânticos. Nesse trabalho foramrealizadoscálculos de estrutura eletrônica com diferentes aproximações para tentar reproduzir os dados de difração de raios X.O método semiempíricoPM6foi aquele que mostrou maior reprodutibilidade dos dados experimentais. Esse resultado otimiza ainda a relação entre esforço computacional e reprodutibilidade de dados, pois o método semiempíricoPM6é sabidamente mais barato computacionalmente que aqueles ditos que foram usados neste trabalho.

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de Oliveira, D. A. B., & Gomes, Y. G. dos S. (2016). Geometria de equilíbrio da molécula de Azadiracthin através de métodos semiempíricos e Ab initio em comparação com os dados experimentais fornecidos pela difração de raios X. Eclética Química, 41(1), 94–100. https://doi.org/10.26850/1678-4618eqj.v41.1.2016.p94-100
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Author Biography

Daniel Augusto Barra de Oliveira, Universidade Federal do Tocantins, Araguaina, Brasil.

Possui graduação em QUÍMICA pela Universidade de Brasília (2006), com atuação na área de dinâmica molecular de sistemas biológicos bem como utilização do algoritmo GSA para busca de mínimos globais na superfície de potencial energético. Mestrado em química na área de modelagem molecular de inbidores de transdução sinais, com enfoque no desenvolvimento de fármacos inibidores de metástase em nível biológico a partir de técnicas de química computacional. ( mecânica molecular, cálculos ab-initio, cálculos quânticos semi-empíricos, dinâmica molecular aplicada a docking manual fármaco/receptor). Doutorado em química pela Universidade de Brasília com atuação na área de cálculos QM/MM ( Mecânica Quântica/Mecânica Molecular) para inibidores do câncer a nível bioquímico com enfoque no mecanismo de transdução de sinais. Atuação no desenvolvimento de novos inseticidas inibidores do crescimento de insetos, com enfoque em dengue através de estudos de interação entre a molécula azadiractina e proteína ecdisona via cálculos de estrutura eletrônica e docking molecular. Coordenador do curso de licenciatura em química da Universidade Federal do Tocantins (2015-2017)

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